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财讯:对话地球生物基因组计划团队中国成员:数据将免费对外共享

来源:网络转载更新时间:2021-01-25 07:14:20阅读:

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比人类基因组计划更大的地球生物基因组计划( ebp )即将启动,目标是解读地球上所有生命的基因组。 华大基因成为这个项目的发起人之一,两名科学家参加了地球生物基因组计划小组。 最近,地球生物基因组计划参加者之一、深圳国家基因库副主任、生物多样化基因组学研究负责人张国捷博士近日接受澎湃信息记者的邮件采访时,开展地球生物基因组计划的最大困难是需要全世界的合作,项目 华大基因运营的中国国家基因库将来将在物种资源和基因组数据新闻的保存中发挥重要作用。 到目前为止,“人类基因组计划”“曼哈顿原子弹计划”“阿波罗计划”被称为自然科学史上的“三大计划”。 地球生物基因组计划大于人类基因组计划,它是第一个真正的全球大型基因组测序项目,据说测序“地球上所有的生命”。 这个项目首先集中完成约9330个真核生物科水平的代表物种( eukaryotic family )基因组,获得相当于人类参考基因组或比人类参考基因组更好的参考基因组。 接下来,在14万20万个真核生物属( eukaryotic genera )中,对来自各属的1种进行了基因组草图。 最后,对剩下的150万个已知真核生物种( eukaryotic species )的基因组进行了低间谍测序。 “不同的物种和人类一起构成了自然生态系统 到地球的每个角落都能找到生物的存在 为了了解整个地球的生物新闻,为了完美地涵盖地球上的所有物种,需要构成全球共同合作的事业计划。 ”张国捷对澎湃情报记者说。 澎湃信息显示,华大基因在生物多样化基因组学研究中有十几年的积累,这次被邀请参加这个计划,成为项目的发起单位之一,华大基因理事长杨熙明院士和张国捷也成为了这个项目的成员。 张国捷对澎湃信息记者说,与迄今开展的人类基因组计划相比,地球生物基因组计划需要根据新的样品储藏标准,对全世界物种资源进行更细致、深入的调查和收集。 这个项目进行精细度不同的基因组分解和进一步的测序。 “精细的基因组图像不仅可以传达那些基因,还可以传达基因的顺序、基因的控制开关元件等对基因功能有重要影响的消息。 基因组框架图可以提供绝大多数的基因新闻,可以满足大部分的研究需要。 ”张国捷解释说。 地球生物基因组计划产生超过1eb的数据量,相当于1亿部HD电影,播放2.3万年。 张国捷项目目前面临的困难是庞大的数据量和运算量极大地挑战了it存储和运算技术。 这项事业需要全球合作,不是一个国家能主导整个计划来完成。 张国捷指出,制定测序标准是事业的第一步。 目前未处理的课题还包括经费筹措、样本资源收集、数据积累和计算、公众和人才教育等问题。 但是他相信通过大范围的国际合作,这些问题都会被处理和克服。 现在的项目分工还不明确,张国捷说,华大基因过去几十年研究积累的基因组学测序和分解技术,以及长时间积累的学术合作互联网,在其中发挥重要作用。 另外,华大基因运营的国家基因库也对物种资源和基因组数据新闻的残存起到了重要作用。 地球生物基因组计划项目组预计项目需要投资40亿美元,如果资金到达,预计该计划将在10年内完成。 到目前为止,人类基因组计划的消费长达13年,资金投入了30亿美元,但其数据量不能与地球生物基因组计划同日而语。 张国捷表示,这是由于测序技术的进步,测序的周期和价格大幅缩短。 高通量测量序列可以有效地测量很多物种。 “我们知道人类基因组计划的完成,不仅推动了新的dna技术的诞生,其中许多技术成为现代医疗行业的核心技术,另一方面也创造了价值200亿美元的巨大市场。 根据公开资料,现在基因测序的价格从最初的1亿美元下降到1000美元左右。 地球生物基因组计划继续推动基因测序价格的下降,由此产业受益方面继续扩大。 张国捷说,未来地球生物基因组计划的数据一公布就免费与社会共享,这些资源和新闻在基础研究、农业、医药、卫生方面有潜在广泛的应用。 以林业为例,在人类进化和生活的过程中,人类学会了以经济价值和公司利益决定如何采用土地,但对某个自然区域的地球整体生存能力是盲目的。 森林可以作为木材获得市场价值,也可以作为下游城市的水净化系统使用,这种自然系统的能力与经济价值区别开来称为自然资本。 地球基因组计划收集的数据将来将有助于人类构建经济分解的框架和中心,促进未来的自然恢复和开发工作。 地球基因组的工作是建立这个框架的初期阶段。 这些年来,华大基因一直鼓励人们参加基因测序的项目。 到目前为止,华大基因在香港开展的紫荆花基因组项目已经成功为公众募集了足够的经费。 将来地球生物基因组计划也将吸引越来越多的it界人士参加,组织可能会开发更友好简便的分解工具,让更多的公众参加数据的分解。 华大基因除了积极参与地球生物基因组计划外,还为人工染色体的合成做出了贡献。 3月10日,国际顶级学术期刊《科学》发表,中国科学家发表了4篇研究长文,介绍了真核生物基因组设计和化学合成系列的重大突破,在这个项目中,中国人工合成了4个真核生物染色,“再生” 这个项目也有来自华大基因的科学家 华大基因相关人士向澎湃信息记者介绍,解读生物基因组和人工合成染色体,如“阅读”和“写作”两者相辅相成。 (本文来自澎湃信息,越来越多的原始信息请下载“澎湃信息”APP )

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